107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2420 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2420  HD superfamily phosphohydrolase  100 
 
 
593 aa  1216    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0935  HD superfamily phosphohydrolase-like protein  30.91 
 
 
638 aa  160  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000571801  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1824  metal dependent phosphohydrolase  24.06 
 
 
436 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0158  hypothetical protein  29.07 
 
 
423 aa  103  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.2104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1480  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
494 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1412  metal-dependent phosphohydrolase  26.3 
 
 
400 aa  95.1  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000393703  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0892  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 
518 aa  95.5  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2948  hypothetical protein  26.57 
 
 
413 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.160964  normal  0.0130066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2274  metal dependent phosphohydrolase  22.35 
 
 
469 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2129  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 
388 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000800981  hitchhiker  0.0000761992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1210  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
470 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1245  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1071  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0173536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0626  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0641  metal-dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0511  metal dependent phosphohydrolase  20.94 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39912  predicted protein  22.31 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.694161  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2547  metal dependent phosphohydrolase  22.71 
 
 
475 aa  72.8  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0287  metal dependent phosphohydrolase  22.78 
 
 
469 aa  72  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0438301 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0458  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 
371 aa  72  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.847424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2172  metal dependent phosphohydrolase  23.1 
 
 
469 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0538  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 
459 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5172  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1577  metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00516026 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1790  HD superfamily phosphohydrolase  25.07 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0251  HD domain-containing protein  29.35 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1366  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 
501 aa  68.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.425888  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03591  HD superfamily phosphohydrolase  27.69 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603218  normal  0.796242 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0865  metal dependent phosphohydrolase  49.21 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4439  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2064  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1501  metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.604824  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03491  HD superfamily phosphohydrolase  31.94 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1934  metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 
473 aa  67  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5508  HD domain-containing protein  27.78 
 
 
483 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5076  dGTP triphosphohydrolase  27.78 
 
 
434 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1210  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
434 aa  67  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5557  HD domain protein  27.78 
 
 
434 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5228  HD domain-containing protein  27.78 
 
 
434 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5059  dGTP triphosphohydrolase  27.78 
 
 
434 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1700  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 
419 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5627  HD domain-containing protein  27.78 
 
 
434 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1663  metal dependent phosphohydrolase  40.43 
 
 
395 aa  66.6  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0731  metal dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 
475 aa  66.6  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0777  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 
458 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5471  HD domain protein  27.78 
 
 
434 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0329  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 
418 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2141  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 
402 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.655755  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03551  HD superfamily phosphohydrolase  29.67 
 
 
419 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0223  HD superfamily phosphohydrolase  26.74 
 
 
454 aa  64.3  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.237797  hitchhiker  0.00000000000130835 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1174  metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 
458 aa  64.3  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5449  HD domain protein  27.22 
 
 
434 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5502  HD domain protein  27.22 
 
 
434 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2292  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
487 aa  63.9  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0322637 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03471  HD superfamily phosphohydrolase  31.28 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0059  DNA-directed DNA polymerase  28 
 
 
401 aa  63.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.157318  hitchhiker  0.00506783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
434 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2577  metal dependent phosphohydrolase  45.9 
 
 
402 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl650  HD phosphohydrolase  31.52 
 
 
402 aa  62.8  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0483  metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 
421 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.256165  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1178  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
458 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2262  metal dependent phosphohydrolase  25.91 
 
 
427 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0760  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 
407 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1630  hypothetical protein  24.72 
 
 
399 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21871  HD superfamily phosphohydrolase  29.14 
 
 
413 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1939  metal dependent phosphohydrolase  22.66 
 
 
473 aa  62  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04151  HD superfamily phosphohydrolase  28.72 
 
 
419 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.761915  normal  0.477621 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1706  metal dependent phosphohydrolase  46.55 
 
 
411 aa  61.6  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0614585 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0921  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
472 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0511  HD superfamily phosphohydrolase  23.48 
 
 
448 aa  60.8  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.159978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1167  metal dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 
498 aa  60.8  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464914  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2579  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
407 aa  60.5  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1851  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 
425 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111611  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0224  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 
455 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.41122  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0118  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
401 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.835732  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08156  hypothetical protein  26.83 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1042  metal dependent phosphohydrolase  25.75 
 
 
415 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6492  metal dependent phosphohydrolase  46.03 
 
 
420 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0499013  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1039  HC superfamily phosphohydrolase  24.8 
 
 
411 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.914108  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4281  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  44.26 
 
 
416 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.282547  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1130  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
435 aa  58.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3358  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 
433 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000060416  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2120  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 
467 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0425  metal dependent phosphohydrolase  23.41 
 
 
475 aa  57.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.410662  normal  0.214403 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1569  metal dependent phosphohydrolase  24.23 
 
 
414 aa  57.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1754  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 
405 aa  58.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0194685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0512  HD domain-containing protein  27.27 
 
 
438 aa  57.8  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2443  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 
399 aa  57.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2905  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
409 aa  57.4  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0550186  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0703  HD domain protein  28.08 
 
 
405 aa  57.4  0.0000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3468  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
432 aa  57  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2121  metal-dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 
616 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3017  metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 
438 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000311981  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1281  metal dependent phosphohydrolase  23.45 
 
 
408 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000286263  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1084  metal dependent phosphohydrolase  34.41 
 
 
410 aa  54.3  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0265  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 
429 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0575  metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 
509 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270439  normal  0.229911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1177  HD superfamily phosphohydrolase  23.59 
 
 
447 aa  52.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00433685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2410  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 
411 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3322  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  27.03 
 
 
468 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>