25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2416 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2416  peptidase  100 
 
 		 464 aa  960    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0036  germination protein YpeB  50.55 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1792  germination protein YpeB  42.52 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0608  peptidase  38.39 
 
 		 444 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.923748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0040  germination protein YpeB  36.77 
 
 		 454 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3194  peptidase  37.84 
 
 		 452 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03070  Spore germination YpeB  36.47 
 
 		 443 aa  302  9e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0201  peptidase  34.62 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2185  putative spore germination protein  30.62 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2174  germination protein YpeB  26.14 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2533  germination protein YpeB  28.57 
 
 		 446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000080241 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2759  germination protein YpeB  28.57 
 
 		 446 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2801  germination protein YpeB  28.57 
 
 		 446 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2780  hypothetical protein  28.8 
 
 		 446 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0914659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2482  hypothetical protein  28.34 
 
 		 446 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235503  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2517  hypothetical protein  28.34 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0450  germination protein YpeB  27.05 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2552  spore germination YpeB  27.75 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2755  germination protein YpeB  28.34 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2561  hypothetical protein  28.34 
 
 		 446 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000903794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2747  hypothetical protein  28.34 
 
 		 446 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1896  spore germination YpeB  27.89 
 
 		 446 aa  191  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00637091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4848  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.38 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.276733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1708  hypothetical protein  25.32 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.283078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2601  hypothetical protein  27.85 
 
 		 474 aa  43.5  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>