24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0450 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0450  germination protein YpeB  100 
 
 
447 aa  922    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2174  germination protein YpeB  78.48 
 
 
447 aa  751    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1896  spore germination YpeB  64.35 
 
 
446 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00637091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2517  hypothetical protein  62.56 
 
 
446 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2533  germination protein YpeB  62.78 
 
 
446 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000080241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2801  germination protein YpeB  62.56 
 
 
446 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2755  germination protein YpeB  62.56 
 
 
446 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2759  germination protein YpeB  62.33 
 
 
446 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2780  hypothetical protein  62.56 
 
 
446 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0914659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2552  spore germination YpeB  61.88 
 
 
446 aa  608  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00289687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2482  hypothetical protein  62.56 
 
 
446 aa  610  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235503  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2747  hypothetical protein  62.33 
 
 
446 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2561  hypothetical protein  62.33 
 
 
446 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000903794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3194  peptidase  30.5 
 
 
452 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2416  peptidase  27.05 
 
 
464 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0608  peptidase  29.31 
 
 
444 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.923748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03070  Spore germination YpeB  30.09 
 
 
443 aa  193  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0036  germination protein YpeB  26.82 
 
 
463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0201  peptidase  29.84 
 
 
459 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0040  germination protein YpeB  27.11 
 
 
454 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1792  germination protein YpeB  26.71 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4848  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.27 
 
 
454 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.276733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2185  putative spore germination protein  27.74 
 
 
457 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1708  hypothetical protein  30.82 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.283078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>