24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3194 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3194  peptidase  100 
 
 
452 aa  926    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0040  germination protein YpeB  42.51 
 
 
454 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1792  germination protein YpeB  36.78 
 
 
466 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03070  Spore germination YpeB  37.84 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2416  peptidase  37.84 
 
 
464 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0608  peptidase  38.73 
 
 
444 aa  315  8e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.923748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0036  germination protein YpeB  34.58 
 
 
463 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2185  putative spore germination protein  35.81 
 
 
457 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0201  peptidase  35.68 
 
 
459 aa  286  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1896  spore germination YpeB  30.7 
 
 
446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00637091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0450  germination protein YpeB  30.5 
 
 
447 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2174  germination protein YpeB  30.48 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2780  hypothetical protein  29.64 
 
 
446 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0914659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2801  germination protein YpeB  29.57 
 
 
446 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2759  germination protein YpeB  29.8 
 
 
446 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2517  hypothetical protein  29.57 
 
 
446 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2482  hypothetical protein  29.57 
 
 
446 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2755  germination protein YpeB  29.57 
 
 
446 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2533  germination protein YpeB  29.19 
 
 
446 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000080241 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2747  hypothetical protein  29.8 
 
 
446 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2561  hypothetical protein  29.8 
 
 
446 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000903794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2552  spore germination YpeB  29.25 
 
 
446 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4848  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.58 
 
 
454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.276733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1708  hypothetical protein  25.52 
 
 
415 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.283078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>