24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03070 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_03070  Spore germination YpeB  100 
 
 
443 aa  907    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3194  peptidase  37.84 
 
 
452 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2416  peptidase  36.47 
 
 
464 aa  302  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0040  germination protein YpeB  36.1 
 
 
454 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0201  peptidase  37.78 
 
 
459 aa  292  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0608  peptidase  37.67 
 
 
444 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.923748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0036  germination protein YpeB  31.99 
 
 
463 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1792  germination protein YpeB  35.32 
 
 
466 aa  262  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2185  putative spore germination protein  34.22 
 
 
457 aa  259  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2174  germination protein YpeB  29.8 
 
 
447 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0450  germination protein YpeB  30.09 
 
 
447 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2552  spore germination YpeB  27.63 
 
 
446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2533  germination protein YpeB  26.71 
 
 
446 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000080241 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2755  germination protein YpeB  26.94 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1896  spore germination YpeB  27.17 
 
 
446 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00637091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2801  germination protein YpeB  26.48 
 
 
446 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2759  germination protein YpeB  26.26 
 
 
446 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2482  hypothetical protein  26.71 
 
 
446 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235503  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2517  hypothetical protein  26.71 
 
 
446 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2780  hypothetical protein  26.48 
 
 
446 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0914659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2747  hypothetical protein  26.48 
 
 
446 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2561  hypothetical protein  26.48 
 
 
446 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000903794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4848  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.28 
 
 
454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.276733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1708  hypothetical protein  25.75 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.283078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>