24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2185 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2185  putative spore germination protein  100 
 
 
457 aa  907    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0040  germination protein YpeB  35.53 
 
 
454 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3194  peptidase  35.81 
 
 
452 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0608  peptidase  34.15 
 
 
444 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.923748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03070  Spore germination YpeB  34.22 
 
 
443 aa  269  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2416  peptidase  31.28 
 
 
464 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1792  germination protein YpeB  31.21 
 
 
466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0036  germination protein YpeB  28.7 
 
 
463 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0201  peptidase  31.4 
 
 
459 aa  209  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4848  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.19 
 
 
454 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.276733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2801  germination protein YpeB  25.27 
 
 
446 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2174  germination protein YpeB  26.29 
 
 
447 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2759  germination protein YpeB  25.49 
 
 
446 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2780  hypothetical protein  25.05 
 
 
446 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0914659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2517  hypothetical protein  25.05 
 
 
446 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2755  germination protein YpeB  25.05 
 
 
446 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2482  hypothetical protein  24.84 
 
 
446 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2561  hypothetical protein  25.05 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000903794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2533  germination protein YpeB  25.05 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000080241 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2747  hypothetical protein  25.05 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1896  spore germination YpeB  24.62 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00637091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0450  germination protein YpeB  28.17 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2552  spore germination YpeB  24.62 
 
 
446 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1708  hypothetical protein  30.43 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.283078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>