47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0213 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0213  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  39.83 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5152  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000285957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5393  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62077e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4984  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  95.5  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0797538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5544  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000271519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5002  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5527  integral membrane protein  45.1 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000108543  hitchhiker  0.0000000242358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2194  protein of unknown function DUF975  46.15 
 
 
216 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5427  hypothetical protein  40.68 
 
 
217 aa  92  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2008  hypothetical protein  44.72 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000169588  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2658  hypothetical protein  44.8 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2675  hypothetical protein  44.8 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2476  hypothetical protein  44.8 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.058907  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5609  hypothetical protein  44.72 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5100  hypothetical protein  40.2 
 
 
217 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3114  hypothetical protein  44 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5423  integral membrane protein  45.88 
 
 
214 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4213  integral membrane protein  44.19 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.395001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3044  hypothetical protein  38.1 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181685  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23050  predicted integral membrane protein  39.02 
 
 
315 aa  79  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1989  hypothetical protein  41.35 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5480  hypothetical protein  37.62 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3823  hypothetical protein  40.2 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5428  hypothetical protein  36.63 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5394  hypothetical protein  38 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58278e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5545  hypothetical protein  38 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000433429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5101  hypothetical protein  37.78 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5153  hypothetical protein  38 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000141896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5424  group-specific protein  36.67 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00185358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5526  group-specific protein  35.56 
 
 
261 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173284  hitchhiker  0.0000000104917 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5003  group-specific protein  38 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4985  hypothetical protein  38 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0146407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0026  integral membrane protein  38.78 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.667689  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  37.5 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0105  hypothetical protein  34.91 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3083  protein of unknown function DUF975  33.64 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0101  hypothetical protein  32.69 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000075579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3822  hypothetical protein  45.45 
 
 
116 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0528  integral membrane protein  34.29 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0309  hypothetical protein  36.11 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0315  hypothetical protein  36.11 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.428114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2383  protein of unknown function DUF975  40 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1063  integral membrane protein  34.95 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000155002  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0102  hypothetical protein  35.94 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000170522  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0395  hypothetical protein  41.07 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5479  integral membrane protein  41.3 
 
 
146 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>