46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0528 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0528  integral membrane protein  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0026  integral membrane protein  37.07 
 
 
247 aa  139  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.667689  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  39.46 
 
 
200 aa  102  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4984  hypothetical protein  40.8 
 
 
217 aa  98.6  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0797538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5393  hypothetical protein  40.8 
 
 
217 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62077e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5152  hypothetical protein  40.8 
 
 
217 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000285957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5002  hypothetical protein  40.8 
 
 
217 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5544  hypothetical protein  40.8 
 
 
217 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000271519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5527  integral membrane protein  40.8 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000108543  hitchhiker  0.0000000242358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2194  protein of unknown function DUF975  29.79 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5427  hypothetical protein  31.17 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5100  hypothetical protein  40.8 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5423  integral membrane protein  31.74 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  38.93 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3114  hypothetical protein  32.89 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4213  integral membrane protein  29.69 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.395001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2008  hypothetical protein  37.61 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000169588  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2658  hypothetical protein  30.77 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2675  hypothetical protein  30.77 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2476  hypothetical protein  30.77 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.058907  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5609  hypothetical protein  35.04 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1989  hypothetical protein  32.58 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0395  hypothetical protein  29.12 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3044  hypothetical protein  35.78 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181685  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23050  predicted integral membrane protein  37.25 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1063  integral membrane protein  33.59 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000155002  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0101  hypothetical protein  32.97 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000075579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0105  hypothetical protein  32.48 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5394  hypothetical protein  36.05 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58278e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5545  hypothetical protein  36.05 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000433429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5003  group-specific protein  36.05 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4985  hypothetical protein  36.05 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0146407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5153  hypothetical protein  36.05 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000141896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5101  hypothetical protein  34.48 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5428  hypothetical protein  33.72 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5480  hypothetical protein  33.72 
 
 
264 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5479  integral membrane protein  28.95 
 
 
146 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0160  hypothetical protein  21.61 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5424  group-specific protein  33.7 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00185358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3823  hypothetical protein  30.33 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5526  group-specific protein  32.61 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173284  hitchhiker  0.0000000104917 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3822  hypothetical protein  45.76 
 
 
116 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0213  hypothetical protein  37.8 
 
 
257 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0102  hypothetical protein  46.34 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3083  protein of unknown function DUF975  30.61 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5478  hypothetical protein  44.74 
 
 
55 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>