41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1063 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1063  integral membrane protein  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000155002  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0026  integral membrane protein  34.96 
 
 
247 aa  149  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.667689  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  34.22 
 
 
200 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1989  hypothetical protein  29.33 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5527  integral membrane protein  33.49 
 
 
214 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000108543  hitchhiker  0.0000000242358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2476  hypothetical protein  35.12 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.058907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2675  hypothetical protein  35.12 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159385 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2658  hypothetical protein  35.12 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  32.7 
 
 
217 aa  92  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4984  hypothetical protein  33.97 
 
 
217 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0797538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3114  hypothetical protein  33.5 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5002  hypothetical protein  33.97 
 
 
217 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5393  hypothetical protein  33.97 
 
 
217 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.62077e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5544  hypothetical protein  33.97 
 
 
217 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000271519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5152  hypothetical protein  33.97 
 
 
217 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000285957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5100  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5609  hypothetical protein  34.2 
 
 
252 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5427  hypothetical protein  32.52 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2008  hypothetical protein  30.46 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000169588  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4213  integral membrane protein  35.58 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.395001 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0528  integral membrane protein  33.59 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2194  protein of unknown function DUF975  28.37 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5423  integral membrane protein  33.33 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3822  hypothetical protein  42.06 
 
 
116 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2383  protein of unknown function DUF975  47.37 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23050  predicted integral membrane protein  32.8 
 
 
315 aa  62.4  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5479  integral membrane protein  31.37 
 
 
146 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3044  hypothetical protein  28.04 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000181685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5428  hypothetical protein  40.58 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5424  group-specific protein  40.26 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00185358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5480  hypothetical protein  40.58 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5003  group-specific protein  39.13 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4985  hypothetical protein  39.13 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0146407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5545  hypothetical protein  39.13 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000433429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5394  hypothetical protein  39.13 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58278e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5153  hypothetical protein  39.13 
 
 
263 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000141896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5101  hypothetical protein  40.26 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5526  group-specific protein  38.96 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173284  hitchhiker  0.0000000104917 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3823  hypothetical protein  40.26 
 
 
266 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3083  protein of unknown function DUF975  43.1 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0160  hypothetical protein  23.32 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>