70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7123 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7123  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
192 aa  400  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4049  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.79 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3908  hypothetical protein  22.28 
 
 
186 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0954  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.72 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1884  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.52 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2937  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2480  redoxin domain-containing protein  31.19 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3955  AhpC/Tsa family protein  26.92 
 
 
157 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.888596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.29 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0435  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.29 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000831431  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2180  bacterioferritin comigratory protein  25.71 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.739986 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0230  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  28 
 
 
148 aa  47.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.242968  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2381  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  24.84 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1740  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  28.16 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2201  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.09 
 
 
164 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2480  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  24.84 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.813265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0586  alkyl hydroperoxide reductase  31.48 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0601153  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2142  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.43 
 
 
149 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.847657  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3138  hypothetical protein  24.85 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31343  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3859  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1546  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
157 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.0266249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0194  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.070617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3959  redoxin  26.67 
 
 
146 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.218206  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2815  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
173 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2356  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.11 
 
 
151 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0149513  normal  0.0272325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29090  Peroxiredoxin  27.37 
 
 
159 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00860  Peroxiredoxin  29.52 
 
 
152 aa  44.7  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35360  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.4 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11693  hypothetical protein  22.58 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.518225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.1 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000836968  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2307  putative bacterioferritin comigratory (BCP) protein  27.04 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.96 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.75 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1658  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1704  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178423  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4120  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585528  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2535  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1488  hypothetical protein  27.63 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002791  thiol peroxidase Bcp-type  24.22 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.74 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1006  hypothetical protein  25.88 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5635  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1676  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.14 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3644  redoxin  21.69 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3717  redoxin domain-containing protein  21.69 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.050319  normal  0.718647 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0101  redoxin domain-containing protein  27.45 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0122  redoxin  25.96 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000117403  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3657  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.69 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.517084  normal  0.0138623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1362  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.55 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3638  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3514  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.64 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.31 
 
 
206 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1265  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.08 
 
 
157 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.727107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4183  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.08 
 
 
157 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02611  putative bacterioferritin comigratory (BCP) protein  27.52 
 
 
155 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03189  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  24.07 
 
 
156 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.37 
 
 
148 aa  42  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2063  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.74 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00881  putative bacterioferritin comigratory (BCP) protein  25.35 
 
 
158 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.364893  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1235  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.12 
 
 
157 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.888046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1322  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.5 
 
 
157 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0766  peroxiredoxin  34.85 
 
 
155 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02139  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  23.46 
 
 
154 aa  41.6  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.178426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.83 
 
 
151 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880593  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0205  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  28.42 
 
 
148 aa  41.6  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.830978  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2624  Peroxiredoxin  23.76 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0377207  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0297  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.83 
 
 
151 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2976  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  24.2 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2986  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  24.66 
 
 
155 aa  41.2  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>