30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2612 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2612  putative stage IV sporulation YqfD  100 
 
 
412 aa  839    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0573  sporulation protein YqfD  26.39 
 
 
398 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0133  sporulation protein YqfD  26.09 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.36318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2049  putative stage IV sporulation YqfD  27.56 
 
 
405 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3071  sporulation protein YqfD  27.04 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000533846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1072  putative stage IV sporulation YqfD  26.08 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3032  putative stage IV sporulation YqfD  28.5 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.957199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0592  putative stage IV sporulation YqfD  25.74 
 
 
429 aa  126  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.117032  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2485  putative stage IV sporulation YqfD  25.73 
 
 
428 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1023  sporulation protein YqfD  27.62 
 
 
395 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4157  putative stage IV sporulation YqfD  28.47 
 
 
399 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1339  putative stage IV sporulation YqfD  27.17 
 
 
395 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0753223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12610  putative stage IV sporulation YqfD  27.85 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0813  sporulation protein  27.09 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359866  decreased coverage  1.7590099999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1567  putative stage IV sporulation YqfD  23.66 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4386  sporulation protein  27.34 
 
 
399 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4439  sporulation protein  27.34 
 
 
399 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4423  sporulation protein  27.34 
 
 
399 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.892794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4205  sporulation protein  26.85 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4530  sporulation protein  26.85 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4328  sporulation protein  26.85 
 
 
399 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.37155e-52 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4043  stage IV sporulation protein  26.85 
 
 
399 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4053  stage IV sporulation protein  27.59 
 
 
399 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2277  putative stage IV sporulation protein  30.37 
 
 
378 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1992  stage IV sporulation protein, putative  30 
 
 
378 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2427  sporulation protein YqfD  26.05 
 
 
395 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4281  sporulation protein YqfD  22.55 
 
 
403 aa  99.8  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1197  sporulation protein YqfD  25.64 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000171655  normal  0.590758 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1986  sporulation protein YqfD  23.88 
 
 
404 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1271  hypothetical protein  25.22 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.178627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>