30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2277 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2277  putative stage IV sporulation protein  100 
 
 
378 aa  735    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1992  stage IV sporulation protein, putative  99.21 
 
 
378 aa  732    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1339  putative stage IV sporulation YqfD  31.07 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0753223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1072  putative stage IV sporulation YqfD  29.73 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0133  sporulation protein YqfD  26.82 
 
 
454 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.36318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0592  putative stage IV sporulation YqfD  26.21 
 
 
429 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.117032  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2049  putative stage IV sporulation YqfD  23.83 
 
 
405 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3071  sporulation protein YqfD  26.96 
 
 
420 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000533846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2612  putative stage IV sporulation YqfD  30.37 
 
 
412 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1023  sporulation protein YqfD  24.35 
 
 
395 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2485  putative stage IV sporulation YqfD  24.75 
 
 
428 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12610  putative stage IV sporulation YqfD  27.63 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1567  putative stage IV sporulation YqfD  25.94 
 
 
407 aa  96.3  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2427  sporulation protein YqfD  24.41 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1197  sporulation protein YqfD  26.62 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000171655  normal  0.590758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0573  sporulation protein YqfD  26.09 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1271  hypothetical protein  31.6 
 
 
381 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.178627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3032  putative stage IV sporulation YqfD  25.52 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.957199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4157  putative stage IV sporulation YqfD  24.8 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4281  sporulation protein YqfD  21.65 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0813  sporulation protein  24.01 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359866  decreased coverage  1.7590099999999999e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1986  sporulation protein YqfD  22.76 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4423  sporulation protein  23.75 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.892794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4053  stage IV sporulation protein  23.96 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4043  stage IV sporulation protein  23.62 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4205  sporulation protein  24.22 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4386  sporulation protein  23.22 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4328  sporulation protein  23.62 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.37155e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4530  sporulation protein  24.22 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4439  sporulation protein  22.96 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>