30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2485 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2485  putative stage IV sporulation YqfD  100 
 
 
428 aa  857    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3071  sporulation protein YqfD  47.99 
 
 
420 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000533846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2049  putative stage IV sporulation YqfD  42.13 
 
 
405 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0133  sporulation protein YqfD  40.88 
 
 
454 aa  300  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.36318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0592  putative stage IV sporulation YqfD  37.35 
 
 
429 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.117032  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1072  putative stage IV sporulation YqfD  34.2 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1567  putative stage IV sporulation YqfD  32.44 
 
 
407 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12610  putative stage IV sporulation YqfD  31.78 
 
 
389 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4281  sporulation protein YqfD  32.44 
 
 
403 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0573  sporulation protein YqfD  31.33 
 
 
398 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1339  putative stage IV sporulation YqfD  29.78 
 
 
395 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0753223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1197  sporulation protein YqfD  29.29 
 
 
406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000171655  normal  0.590758 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3032  putative stage IV sporulation YqfD  26.32 
 
 
399 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.957199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1023  sporulation protein YqfD  25.86 
 
 
395 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2427  sporulation protein YqfD  25.06 
 
 
395 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2612  putative stage IV sporulation YqfD  25.73 
 
 
412 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1986  sporulation protein YqfD  30.36 
 
 
404 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4157  putative stage IV sporulation YqfD  25.06 
 
 
399 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4053  stage IV sporulation protein  25.06 
 
 
399 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4439  sporulation protein  25.49 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4423  sporulation protein  25.31 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.892794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0813  sporulation protein  25.55 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359866  decreased coverage  1.7590099999999999e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4386  sporulation protein  25.06 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4530  sporulation protein  25.06 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4205  sporulation protein  25.06 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4328  sporulation protein  25.06 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.37155e-52 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4043  stage IV sporulation protein  25.06 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2277  putative stage IV sporulation protein  24.75 
 
 
378 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1992  stage IV sporulation protein, putative  24.75 
 
 
378 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1271  hypothetical protein  26.58 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.178627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>