30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1072 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1072  putative stage IV sporulation YqfD  100 
 
 		 398 aa  793    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0573  sporulation protein YqfD  49.25 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1339  putative stage IV sporulation YqfD  34.01 
 
 		 395 aa  229  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0753223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2485  putative stage IV sporulation YqfD  34.2 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0133  sporulation protein YqfD  34.59 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.36318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2049  putative stage IV sporulation YqfD  33.91 
 
 		 405 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3071  sporulation protein YqfD  32.38 
 
 		 420 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000533846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12610  putative stage IV sporulation YqfD  30.08 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1567  putative stage IV sporulation YqfD  30.15 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0592  putative stage IV sporulation YqfD  28.12 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.117032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1197  sporulation protein YqfD  28.18 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000171655  normal  0.590758 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3032  putative stage IV sporulation YqfD  30.08 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.957199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4157  putative stage IV sporulation YqfD  29.12 
 
 		 399 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4386  sporulation protein  28.87 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2427  sporulation protein YqfD  28.21 
 
 		 395 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4439  sporulation protein  28.87 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0813  sporulation protein  29.12 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359866  decreased coverage  1.7590099999999999e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4053  stage IV sporulation protein  28.61 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2612  putative stage IV sporulation YqfD  26.08 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4423  sporulation protein  29.12 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.892794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1023  sporulation protein YqfD  27.02 
 
 		 395 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4328  sporulation protein  28.61 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.37155e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4530  sporulation protein  28.87 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4043  stage IV sporulation protein  28.61 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4205  sporulation protein  28.87 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4281  sporulation protein YqfD  25.25 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2277  putative stage IV sporulation protein  29.73 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1992  stage IV sporulation protein, putative  29.05 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1986  sporulation protein YqfD  25.86 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1271  hypothetical protein  31.39 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.178627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>