More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1335 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1335  acetylglutamate kinase  100 
 
 
305 aa  617  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.044154  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1074  acetylglutamate kinase  77.08 
 
 
302 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1047  acetylglutamate kinase  77.03 
 
 
305 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1322  acetylglutamate kinase  75.17 
 
 
308 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1381  acetylglutamate kinase  74.56 
 
 
304 aa  431  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1247  acetylglutamate kinase  74.73 
 
 
304 aa  430  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0774  acetylglutamate kinase  74.37 
 
 
286 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  51.25 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  46.46 
 
 
301 aa  254  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  46.46 
 
 
301 aa  254  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  48.25 
 
 
292 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  48.08 
 
 
298 aa  251  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  48.61 
 
 
300 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  47.35 
 
 
304 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  47.48 
 
 
299 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  45.15 
 
 
301 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  45.15 
 
 
301 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  45.15 
 
 
301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  45.15 
 
 
301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  45.64 
 
 
294 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  46.71 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  46.86 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  47.06 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  45.12 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  47.87 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  46.86 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  45.68 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  45.3 
 
 
301 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  46.55 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  47.69 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  46.55 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  47.67 
 
 
300 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  45.64 
 
 
304 aa  241  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  47.79 
 
 
283 aa  241  9e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  44.26 
 
 
301 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  46.74 
 
 
293 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  46.29 
 
 
290 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  44.26 
 
 
301 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  48.38 
 
 
293 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  46.15 
 
 
303 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  42.6 
 
 
288 aa  239  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0887  acetylglutamate kinase  44.03 
 
 
294 aa  238  8e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.380786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  45.32 
 
 
296 aa  238  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2911  acetylglutamate kinase  45.07 
 
 
303 aa  238  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  47.48 
 
 
310 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  47.84 
 
 
309 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  43.14 
 
 
302 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  44.68 
 
 
290 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  46.07 
 
 
292 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  46.43 
 
 
292 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  43.56 
 
 
305 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  46.76 
 
 
308 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  46.76 
 
 
308 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1614  acetylglutamate kinase  44.48 
 
 
294 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  45.71 
 
 
292 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  44.8 
 
 
299 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  47.18 
 
 
294 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  47.48 
 
 
344 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1078  acetylglutamate kinase  43.55 
 
 
294 aa  236  4e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  46.04 
 
 
297 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  45.23 
 
 
292 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0327  acetylglutamate kinase  47.48 
 
 
287 aa  235  6e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  46.3 
 
 
280 aa  235  6e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  46.07 
 
 
292 aa  235  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  44.91 
 
 
301 aa  235  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  47.84 
 
 
299 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  44.06 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0415  acetylglutamate kinase  49.48 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0188997  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  46.04 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  47.84 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  45.42 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  46.71 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  45.68 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  44.37 
 
 
295 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  48.4 
 
 
296 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  42.41 
 
 
295 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  45.96 
 
 
304 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  46.98 
 
 
295 aa  233  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1950  acetylglutamate kinase  43.46 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  47.48 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  44.22 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  47.48 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1060  acetylglutamate kinase  44.03 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  46.04 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  46.04 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  45.16 
 
 
306 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0056  acetylglutamate kinase  47 
 
 
304 aa  232  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  47.12 
 
 
351 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  47.12 
 
 
351 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  47.12 
 
 
299 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  46.13 
 
 
297 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  47.12 
 
 
351 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  47.12 
 
 
299 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  47.12 
 
 
351 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  47.12 
 
 
299 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  44.52 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  45.68 
 
 
296 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0160  acetylglutamate kinase  47.12 
 
 
355 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1078  acetylglutamate kinase  45.52 
 
 
293 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  47.12 
 
 
293 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>