11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2522 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2522  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00109923  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 581 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 557 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 538 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 545 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  24.32 
 
 		 566 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 545 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  22.63 
 
 		 579 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  22.86 
 
 		 570 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  26.21 
 
 		 545 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>