12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1056 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1056  Brix  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123368  hitchhiker  0.000000052203 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0833  ribosomal biogenesis protein  29.78 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0577893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1940  ribosomal biogenesis protein  30.68 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0920  ribosomal biogenesis protein  30.73 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1378  ribosomal biogenesis protein  25.99 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.745647  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1789  Brix domain protein  28.57 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0260354  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29310  predicted protein  42.86 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0080  ribosomal biogenesis protein, containing Brix domain  37.63 
 
 		 159 aa  52  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.158541  hitchhiker  0.00026284 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90419  predicted protein  29.91 
 
 		 283 aa  51.6  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0411733  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01090  rRNA primary transcript binding protein, putative  32.26 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51007  predicted protein  33.33 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.612062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1260  ribosomal biogenesis protein  29.76 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.837937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>