8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1789 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1789  Brix domain protein  100 
 
 		 170 aa  340  4e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0260354  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0833  ribosomal biogenesis protein  35.56 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0577893 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0080  ribosomal biogenesis protein, containing Brix domain  37.84 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.158541  hitchhiker  0.00026284 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1940  ribosomal biogenesis protein  30.6 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1056  Brix  28.57 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123368  hitchhiker  0.000000052203 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1378  ribosomal biogenesis protein  36.05 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.745647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0920  ribosomal biogenesis protein  31.52 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29310  predicted protein  31.4 
 
 		 291 aa  40.8  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>