10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1260 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1260  ribosomal biogenesis protein  100 
 
 		 163 aa  328  1e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.837937  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1426  ribosomal biogenesis protein  67.68 
 
 		 164 aa  228  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1249  ribosomal biogenesis protein  67.07 
 
 		 164 aa  226  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0706  ribosomal biogenesis protein  67.07 
 
 		 164 aa  226  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0177  ribosomal biogenesis protein  42.26 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.597571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3051  ribosomal biogenesis protein  31.46 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00941584  normal  0.774627 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0203  ribosomal biogenesis protein  34.62 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0080  ribosomal biogenesis protein, containing Brix domain  38.24 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.158541  hitchhiker  0.00026284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1056  Brix  29.76 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.123368  hitchhiker  0.000000052203 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0833  ribosomal biogenesis protein  28.17 
 
 		 181 aa  40.8  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0577893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>