24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1176 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1176  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1084  hypothetical protein  48.6 
 
 
195 aa  201  6e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0568  hypothetical protein  49.2 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1846  hypothetical protein  48.39 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1289  hypothetical protein  43.55 
 
 
196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0819  hypothetical protein  43.55 
 
 
189 aa  177  7e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000155575  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  25.42 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3173  L-fuculose phosphate aldolase  26.86 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1801  L-fuculose phosphate aldolase  26.16 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30516  normal  0.168684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2210  L-fuculose phosphate aldolase  28.02 
 
 
183 aa  61.2  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000461155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1027  L-fuculose phosphate aldolase  25.56 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1037  class II aldolase/adducin family protein  28.47 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.093036  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0314  L-fuculose phosphate aldolase  26.29 
 
 
178 aa  55.1  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1450  L-fuculose phosphate aldolase  21.23 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.571414  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  21.93 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  27.47 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1641  L-fuculose phosphate aldolase  27.17 
 
 
193 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.515005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  25.47 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  23.81 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1523  aldolase, class II  26.59 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.854462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  22.1 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  18.42 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  21.55 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  23.4 
 
 
217 aa  41.2  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>