23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1846 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1846  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1084  hypothetical protein  83.59 
 
 
195 aa  349  1e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0568  hypothetical protein  65.13 
 
 
197 aa  284  5.999999999999999e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0819  hypothetical protein  60.85 
 
 
189 aa  260  8e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000155575  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1289  hypothetical protein  53.09 
 
 
196 aa  230  1e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1176  hypothetical protein  48.39 
 
 
192 aa  209  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1037  class II aldolase/adducin family protein  30.34 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.093036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3173  L-fuculose phosphate aldolase  25.84 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1801  L-fuculose phosphate aldolase  22.78 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30516  normal  0.168684 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0314  L-fuculose phosphate aldolase  25.13 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  25.57 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1641  L-fuculose phosphate aldolase  23.39 
 
 
193 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.515005  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  21.08 
 
 
229 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  23.08 
 
 
303 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  23.67 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1027  L-fuculose phosphate aldolase  21.62 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2736  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.75 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  24.74 
 
 
332 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1523  aldolase, class II  21.64 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.854462  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  25.9 
 
 
242 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0872  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.15 
 
 
223 aa  42  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  27.08 
 
 
220 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1385  L-fuculose phosphate aldolase  22.02 
 
 
193 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.190215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>