More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0612 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0612  cell division ATP-binding protein FtsE  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1413  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  84.86 
 
 
221 aa  388  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.135411  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1293  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  84.86 
 
 
221 aa  388  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.460365  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0448  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  83.94 
 
 
221 aa  384  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0478  methionine import ATP-binding protein MetN  68.04 
 
 
223 aa  315  3e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1217  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  67.73 
 
 
223 aa  308  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0505  50S ribosomal protein L25 (general stress protein Ctc)  67.12 
 
 
223 aa  307  6.999999999999999e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.522593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1286  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  62.39 
 
 
229 aa  274  6e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.205904  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0642  ABC transporter related protein  58.45 
 
 
223 aa  266  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0786  ABC transporter-related protein  57.53 
 
 
223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  40.99 
 
 
223 aa  165  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  40.09 
 
 
223 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  40.27 
 
 
223 aa  158  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4174  cell division ATP-binding protein FtsE  41.03 
 
 
222 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00105133  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  38.18 
 
 
229 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.46 
 
 
230 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  40.82 
 
 
230 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2019  ABC transporter related  40.3 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000471026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  41.87 
 
 
227 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  38.91 
 
 
233 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.91 
 
 
233 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
233 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
233 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  45.36 
 
 
240 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  38.91 
 
 
233 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
233 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
233 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3207  ABC transporter related  41.95 
 
 
227 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
233 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4585  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  40.59 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1205  cell division ATP-binding protein FtsE  39.44 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0290  cell division ATP-binding protein FtsE  40.59 
 
 
238 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0172  cell division ATP-binding protein FtsE  40.1 
 
 
237 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000152449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5160  cell division ATP-binding protein FtsE  40.51 
 
 
223 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4163  cell division ATP-binding protein FtsE  40.1 
 
 
237 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000108411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4093  cell division ATP-binding protein FtsE  40.1 
 
 
237 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4294  cell division ATP-binding protein FtsE  40.1 
 
 
237 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000113777  normal  0.0247872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5336  cell division ATP-binding protein FtsE  41.03 
 
 
223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2892  ABC transporter related  39.37 
 
 
237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.688447  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3773  cell division ATP-binding protein FtsE  40.59 
 
 
233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000852689  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3846  cell division ATP-binding protein FtsE  40.59 
 
 
233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3971  cell division ATP-binding protein FtsE  40.59 
 
 
233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00007474  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  41.29 
 
 
242 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0428  cell division ATP-binding protein FtsE  40 
 
 
223 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
233 aa  151  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  42.16 
 
 
228 aa  151  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48090  Cell-division ATP-binding protein FtsE  40.51 
 
 
222 aa  151  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0355  cell division ATP-binding protein FtsE  40.51 
 
 
223 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  38.46 
 
 
232 aa  151  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5110  cell division ATP-binding protein FtsE  40.51 
 
 
225 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4750  ABC transporter  40 
 
 
223 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199681  normal  0.0424479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4983  cell division ATP-binding protein FtsE  40.51 
 
 
223 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0624  cell division ATP-binding protein FtsE  41.38 
 
 
222 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  42.41 
 
 
235 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 
233 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
227 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 
233 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1676  ATP-binding component of a membrane-associated cell division complex FtsE  38.89 
 
 
247 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 
233 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 
233 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 
233 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1775  cell division ATP-binding protein FtsE  38.27 
 
 
226 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.030617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0469  cell division ATP-binding protein FtsE  39 
 
 
223 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04910  cell division ATP-binding protein FtsE  39 
 
 
223 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0953664  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3467  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  41.21 
 
 
229 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05500  cell division ATP-binding protein FtsE  41.88 
 
 
280 aa  148  5e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0284  cell division ATP-binding protein FtsE  41.75 
 
 
228 aa  148  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.931477  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.33 
 
 
225 aa  148  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0222  cell division protein FtsE  40 
 
 
223 aa  148  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0345347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1407  cell division ATP-binding protein FtsE  42.46 
 
 
229 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0924913  normal  0.397087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0984  cell division ATP-binding protein FtsE  35.89 
 
 
236 aa  148  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1869  ABC transporter related  43.96 
 
 
276 aa  148  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4027  cell division ATP-binding protein  37.81 
 
 
207 aa  148  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  38.5 
 
 
238 aa  148  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1761  cell division ATP-binding protein FtsE  42.46 
 
 
231 aa  147  9e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0252  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  38.81 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3882  cell division protein FtsE  38.81 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.166736  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3746  cell division protein FtsE  38.81 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3772  cell division protein FtsE  38.81 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0100  cell division protein FtsE  40 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1996  cell division ATP-binding protein FtsE  41.9 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.736099  hitchhiker  0.00509364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3945  cell division protein FtsE  38.81 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.29 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3859  cell division protein FtsE  38.81 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3941  cell division protein FtsE  38.81 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  38.31 
 
 
342 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3839  cell division protein FtsE  38.81 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4783  cell division protein FtsE  38.81 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3762  cell division protein FtsE  38.81 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03312  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  38.31 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0253  cell division protein FtsE  38.31 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0159  cell division ATP-binding protein FtsE  41.58 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  38.31 
 
 
342 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1353  hypothetical protein  44.32 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3662  cell division protein FtsE  38.31 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  44.57 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.56 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3867  cell division protein FtsE  39.3 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508824  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03265  hypothetical protein  38.31 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>