36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0029 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0029  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.264372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0042  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0041  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 80 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0066  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.89097e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t27  tRNA-Pro  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0120151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0032  tRNA-Pro  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0312905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0028  tRNA-Pro  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.988711  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0030  tRNA-Pro  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  97.06 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13260  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0382436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0032  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0034  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129809  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0035  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000987265  normal  0.0118441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0058  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210923  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0048  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0036  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0013  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0047  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0063  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0062  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000001951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0049  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098355  normal  0.904271 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0047  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0282  tRNA-Pro  85.29 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000340373  hitchhiker  0.0000247007 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna13  tRNA-Pro  89.36 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0029  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00564676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  84 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0035  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000012695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0031  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000153307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0048  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0021  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.979827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0035  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124879  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0031  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000674228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>