61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_R0029 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_R0029  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00564676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0031  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19520  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00000755205  hitchhiker  0.000000818157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0056  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0023  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0027  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527994  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13260  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0382436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0048  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0197037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0024  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0014  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000112048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0066  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.89097e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0038  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000141075  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0050    89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0050  tRNA-Pro  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA15  tRNA-Pro  86.11 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0008  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.802652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0022  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00244693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0044  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142801  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0035  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000571794  hitchhiker  0.0000531069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0044  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00846239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0049  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098355  normal  0.904271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0066  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0066  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.880566  normal  0.0590794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0018  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.662018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0015  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0042  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.354382  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0030  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.249196  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0001  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0018  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0768542  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0002  tRNA-Pro  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00636416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0041  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0028  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.933296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0018  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0012  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.762181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0023  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0013  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0022  tRNA-Pro  85.94 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.099872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0006  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0036  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854216  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0066  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0067  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750062  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0037  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0001  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0017  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00877292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0063  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305975  normal  0.0658798 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0009  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0064  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0029  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.264372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0049  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.241293 
 
 
-
 
NC_006368  lppt08  tRNA-Pro  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0002  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0003  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.769558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0055  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1688  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0559093  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0030  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.640007  normal  0.447016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0051  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4561  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315757  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0491  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000930823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0034  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>