38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1993 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1993  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  100 
 
 		 68 aa  140  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0937  Cbb3-type cytochrome oxidase component  38.71 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.965722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2423  Cbb3-type cytochrome oxidase component  47.92 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000524605  hitchhiker  0.0000560228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2216  Cbb3-type cytochrome oxidase component  50 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000950787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2213  Cbb3-type cytochrome oxidase component  43.75 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2216  Cbb3-type cytochrome oxidase component  36.21 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274925  normal  0.372176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2218  Cbb3-type cytochrome oxidase component  36.21 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal  0.237009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2203  Cbb3-type cytochrome oxidase component  36.21 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000246119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2168  Cbb3-type cytochrome oxidase component  36.21 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136382  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4489  hypothetical protein  36.21 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2362  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  36.21 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2109  Cbb3-type cytochrome oxidase component  36.21 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0137364  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1967  Cbb3-type cytochrome oxidase component  36.21 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000352913  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2008  Cbb3-type cytochrome oxidase component  36.21 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0549622  hitchhiker  0.0000000168622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1957  Cbb3-type cytochrome oxidase component  36.84 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3775  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit CcoQ  42.62 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2012  Cbb3-type cytochrome oxidase component  42.31 
 
 		 58 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000185273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2606  Cbb3-type cytochrome oxidase component  39.39 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000308016  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1793  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  43.48 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0445991  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1849  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.3 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00273202  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1987  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.3 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19990  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit IV  39.68 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44390  putative cytochrome c oxidase subunit  39.34 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3779  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit CcoQ  39.34 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2071  Cbb3-type cytochrome oxidase component  42.86 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1051  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  40 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.203141  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003469  cytochrome c oxidase subunit CcoQ  39.22 
 
 		 57 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.274679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2601  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.3 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000197802  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1786  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.67 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.569607  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02301  cytochrome c oxidase, subunit CcoQ  39.13 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0715  Cbb3-type cytochrome oxidase component  42.11 
 
 		 58 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000461704  normal  0.185395 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0641  cytochrome c oxidase, subunit CcoQ  37.29 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000266851  normal  0.653768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1565  Cbb3-type cytochrome oxidase component  30 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3822  Cbb3-type cytochrome oxidase component  24.24 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337063  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2002  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  33.93 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3415  Cbb3-type cytochrome oxidase component  35 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.98935  normal  0.0256907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2777  Cbb3-type cytochrome oxidase component  37.78 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1821  Cbb3-type cytochrome oxidase component  29.51 
 
 		 61 aa  40  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.780429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>