40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0937 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0937  Cbb3-type cytochrome oxidase component  100 
 
 		 63 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.965722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3775  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit CcoQ  42.11 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1849  Cbb3-type cytochrome oxidase component  42.11 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00273202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1793  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  41.07 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0445991  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2362  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  38.1 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2008  Cbb3-type cytochrome oxidase component  38.1 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0549622  hitchhiker  0.0000000168622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1967  Cbb3-type cytochrome oxidase component  38.1 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000352913  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2109  Cbb3-type cytochrome oxidase component  38.1 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0137364  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2216  Cbb3-type cytochrome oxidase component  40.35 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000950787  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2216  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.07 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274925  normal  0.372176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2218  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.07 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171973  normal  0.237009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2203  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.07 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000246119  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4489  hypothetical protein  41.07 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2168  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.07 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44390  putative cytochrome c oxidase subunit  38.6 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3779  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit CcoQ  38.6 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1987  Cbb3-type cytochrome oxidase component  43.48 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00177371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1957  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.3 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2213  Cbb3-type cytochrome oxidase component  43.48 
 
 		 55 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1051  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  40.82 
 
 		 54 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.203141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1611  Cbb3-type cytochrome oxidase component  33.33 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00500182  normal  0.0106574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4257  Cbb3-type cytochrome oxidase component  33.33 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.747274 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2012  Cbb3-type cytochrome oxidase component  43.48 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000185273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19990  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit IV  38.6 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2071  Cbb3-type cytochrome oxidase component  38.89 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003469  cytochrome c oxidase subunit CcoQ  40 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.274679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2606  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.67 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000308016  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3822  Cbb3-type cytochrome oxidase component  31.25 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337063  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2423  Cbb3-type cytochrome oxidase component  39.13 
 
 		 55 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000524605  hitchhiker  0.0000560228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1993  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  38.71 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02301  cytochrome c oxidase, subunit CcoQ  38.3 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1880  Cbb3-type cytochrome oxidase component  32.73 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3575  Cbb3-type cytochrome oxidase component  28.12 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1565  Cbb3-type cytochrome oxidase component  36.73 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1821  Cbb3-type cytochrome oxidase component  29.82 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.780429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2420  hypothetical protein  32.73 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1279  Cbb3-type cytochrome oxidase component  40 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1786  Cbb3-type cytochrome oxidase component  39.13 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.569607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0641  cytochrome c oxidase, subunit CcoQ  32.73 
 
 		 54 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000266851  normal  0.653768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3415  Cbb3-type cytochrome oxidase component  33.33 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.98935  normal  0.0256907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>