16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0114 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0112  hypothetical protein  91.35 
 
 
389 aa  689    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00718309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0114  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  761    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1305  IG hypothetical 16680  40.4 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22530  hypothetical protein  43.18 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1156  hypothetical protein  41.3 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4039  IG hypothetical 16680  43.18 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  37.65 
 
 
449 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4176  hypothetical protein  43.75 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1700  Serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 
496 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0154574  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3353  hypothetical protein  29.63 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5332  hypothetical protein  36.84 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5092  hypothetical protein  38.6 
 
 
459 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2135  hypothetical protein  35.21 
 
 
349 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5483  hypothetical protein  38.6 
 
 
459 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28040  hypothetical protein  56 
 
 
409 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.803673  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22480  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  42.7  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.606654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>