21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0112 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0112  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  761    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00718309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0114  hypothetical protein  91.35 
 
 
390 aa  679    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1305  IG hypothetical 16680  41.41 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1156  hypothetical protein  42.39 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22530  hypothetical protein  43.18 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4039  IG hypothetical 16680  43.18 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  38.82 
 
 
449 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4176  hypothetical protein  41.67 
 
 
294 aa  46.6  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5332  hypothetical protein  38.46 
 
 
459 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3353  hypothetical protein  29.63 
 
 
473 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5092  hypothetical protein  40.38 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5483  hypothetical protein  40.38 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5414  hypothetical protein  38.46 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22480  hypothetical protein  53.85 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.606654 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4937  hypothetical protein  38.46 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4922  hypothetical protein  38.46 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28040  hypothetical protein  56 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.803673  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0418  hypothetical protein  36.96 
 
 
533 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1330  IG hypothetical 16680  45.24 
 
 
64 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000323486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5590  hypothetical protein  34.62 
 
 
459 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1700  Serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 
496 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0154574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>