22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0418 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0414  hypothetical protein  66.79 
 
 
525 aa  688    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.512337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0418  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1037    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5035  hypothetical protein  24.55 
 
 
459 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5362  hypothetical protein  22.29 
 
 
466 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5590  hypothetical protein  24.55 
 
 
459 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4922  hypothetical protein  23.86 
 
 
459 aa  94  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5483  hypothetical protein  23.86 
 
 
459 aa  93.6  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5092  hypothetical protein  23.86 
 
 
459 aa  93.6  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5366  hypothetical protein  22.55 
 
 
459 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4937  hypothetical protein  23.86 
 
 
459 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5332  hypothetical protein  24.06 
 
 
459 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0715  hypothetical protein  23.75 
 
 
516 aa  90.9  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5414  hypothetical protein  23.26 
 
 
459 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0113  hypothetical protein  27.37 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000218142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0115  hypothetical protein  26.84 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1305  IG hypothetical 16680  22.22 
 
 
411 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4039  IG hypothetical 16680  22.38 
 
 
411 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1156  hypothetical protein  21.19 
 
 
410 aa  60.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1653  hypothetical protein  23.94 
 
 
424 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00215239  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2148  hypothetical protein  22.8 
 
 
443 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1392  hypothetical protein  22.73 
 
 
427 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0120213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0112  hypothetical protein  36.96 
 
 
389 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00718309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>