16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1653 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1653  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  839    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00215239  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1392  hypothetical protein  96.46 
 
 
427 aa  813    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0120213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0715  hypothetical protein  29.08 
 
 
516 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4039  IG hypothetical 16680  21.4 
 
 
411 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1156  hypothetical protein  20.78 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5362  hypothetical protein  20.53 
 
 
466 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5590  hypothetical protein  22.63 
 
 
459 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5035  hypothetical protein  20.4 
 
 
459 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0113  hypothetical protein  25.75 
 
 
416 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000218142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0115  hypothetical protein  26.35 
 
 
416 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1305  IG hypothetical 16680  19.44 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5366  hypothetical protein  21.6 
 
 
459 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4937  hypothetical protein  22.01 
 
 
459 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5332  hypothetical protein  20.75 
 
 
459 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201181 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0418  hypothetical protein  23.55 
 
 
533 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0414  hypothetical protein  26.3 
 
 
525 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.512337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>