23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0113 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0113  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  811    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000218142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0115  hypothetical protein  97.36 
 
 
416 aa  726    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5590  hypothetical protein  25.84 
 
 
459 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5366  hypothetical protein  24.43 
 
 
459 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4937  hypothetical protein  24.5 
 
 
459 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5332  hypothetical protein  24.28 
 
 
459 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201181 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5414  hypothetical protein  24.55 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1156  hypothetical protein  25.44 
 
 
410 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4039  IG hypothetical 16680  28.27 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5092  hypothetical protein  24.72 
 
 
459 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4922  hypothetical protein  23.83 
 
 
459 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5483  hypothetical protein  24.72 
 
 
459 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5035  hypothetical protein  23.83 
 
 
459 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1305  IG hypothetical 16680  26.5 
 
 
411 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0414  hypothetical protein  25.23 
 
 
525 aa  86.3  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.512337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0715  hypothetical protein  26.44 
 
 
516 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5362  hypothetical protein  22.07 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0418  hypothetical protein  26.59 
 
 
533 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1392  hypothetical protein  25.76 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0120213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1653  hypothetical protein  25.62 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00215239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2239  hypothetical protein  23.83 
 
 
249 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1997  hypothetical protein  24.15 
 
 
254 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00380391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0326  hypothetical protein  30.09 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>