24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0115 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0113  hypothetical protein  97.36 
 
 
416 aa  738    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000218142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0115  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  810    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1156  hypothetical protein  25.26 
 
 
410 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5590  hypothetical protein  24.55 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129061 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4039  IG hypothetical 16680  28.37 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0414  hypothetical protein  25.68 
 
 
525 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.512337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5366  hypothetical protein  23.78 
 
 
459 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5332  hypothetical protein  23.83 
 
 
459 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201181 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4937  hypothetical protein  24.21 
 
 
459 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5414  hypothetical protein  23.95 
 
 
459 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1305  IG hypothetical 16680  26.24 
 
 
411 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5035  hypothetical protein  23.61 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0715  hypothetical protein  26.44 
 
 
516 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5483  hypothetical protein  23.39 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4922  hypothetical protein  23.39 
 
 
459 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5092  hypothetical protein  23.39 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0418  hypothetical protein  26.1 
 
 
533 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5362  hypothetical protein  20.22 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1653  hypothetical protein  26.11 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00215239  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1392  hypothetical protein  26.23 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0120213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2239  hypothetical protein  23.53 
 
 
249 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1997  hypothetical protein  24.3 
 
 
254 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00380391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0326  hypothetical protein  30.09 
 
 
311 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2148  hypothetical protein  21.22 
 
 
443 aa  43.5  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>