75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0177 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0177  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0174  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  98.64 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2436  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  54.67 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000109617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0301  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  53 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0308  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  53 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3230  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  58.82 
 
 		 235 aa  226  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000143684  normal  0.121537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3565  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  49.78 
 
 		 230 aa  221  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0664  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  52.97 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1049  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  53.36 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2395  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  49.77 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147527  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1687  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  49.78 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0735742  hitchhiker  0.0000000000669272 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0419  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  44.44 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.700256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1356  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  50.45 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0033  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  50.93 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0291  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  44.04 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.597827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3393  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  38.74 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2152  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  40.09 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5236  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  44.23 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3845  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  42.6 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3895  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  42.6 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0699  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  38.91 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000500445  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06740  putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase  40.81 
 
 		 227 aa  157  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00179112  normal  0.884035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1519  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  40.74 
 
 		 251 aa  157  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2477  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  45.16 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596565  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1322  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  40.1 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1417  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  38.86 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0560  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  40.87 
 
 		 229 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03083  predicted N-acetylmannosamine-6-P epimerase  41.67 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0354  ROK family protein  37.1 
 
 		 525 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4540  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  41.67 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.434248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3553  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  41.67 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3518  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  41.67 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0483  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  41.67 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.738177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03034  hypothetical protein  41.67 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0927  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  38.1 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.24814 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0411  ROK family protein  37.1 
 
 		 525 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3411  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  41.67 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0483  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  41.67 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3528  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  40.28 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3697  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  40.28 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3705  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  41.67 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.373786  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0437  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  39.73 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1378  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  38.79 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3530  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  39.81 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3635  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  39.81 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3600  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  39.81 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0182  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  38.27 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1224  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  38.25 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.541362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3027  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  36.61 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3769  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  37.5 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0520  putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase  42.66 
 
 		 502 aa  131  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1204  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  38.71 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.924645  normal  0.216327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1239  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  38.71 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.385828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1194  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  38.71 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1748  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  36.02 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0207411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08310  putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase  37.22 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.388828  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1401  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  39.63 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2464  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  40.19 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0988106  hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0614  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  36.41 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2775  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  39.17 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1294  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  39.17 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2123  N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase  33.49 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06491  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  34.91 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0270  nifR3 family TIM-barrel protein  31.11 
 
 		 333 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000135334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2840  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  26.03 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2888  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  24 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1003  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase  29.46 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.53 
 
 		 350 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1497  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  24.24 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000991768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0493  1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5- phosphoribosylamino)methylideneamino] imidazole-4-carboxamide isomerase  26.36 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.78 
 
 		 346 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  26.63 
 
 		 428 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0454  putative TIM-barrel protein, nifR3 family protein  33.33 
 
 		 320 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.32 
 
 		 355 aa  41.6  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1221  1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5- phosphoribosylamino)methylideneamino] imidazole-4-carboxamide isomerase  38 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>