19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0048 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0048  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.121962  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  30 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  28.89 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  27.52 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  23.7 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.6 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.89 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  25.14 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.28 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  26.97 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  29.13 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  28.86 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  28.86 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  24.14 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  22.68 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.2 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>