44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07320 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07320  hypothetical protein  100 
 
 
511 aa  1059    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0298  glycosyl transferase family protein  43.05 
 
 
512 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.174752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
331 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 
994 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.85 
 
 
317 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  21.84 
 
 
310 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  23.56 
 
 
316 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
334 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
322 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  25.69 
 
 
316 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 
298 aa  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 
326 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
328 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 
310 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 
307 aa  47  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  25.62 
 
 
312 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  22.34 
 
 
310 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
310 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 
310 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  29.35 
 
 
561 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 
310 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
317 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
306 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
341 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.43 
 
 
329 aa  44.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 
444 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.43 
 
 
329 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
1032 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  22.56 
 
 
642 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  22.58 
 
 
272 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
584 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  29.03 
 
 
286 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1179  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 
308 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 
261 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  26.67 
 
 
333 aa  43.9  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.19 
 
 
256 aa  43.9  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  26.85 
 
 
319 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  22.58 
 
 
267 aa  43.9  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
327 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 
327 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 
327 aa  43.5  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  27.55 
 
 
327 aa  43.5  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 
327 aa  43.5  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  27.55 
 
 
327 aa  43.5  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>