64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_R0009 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_R0009  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0012  tRNA-Arg  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0063  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0050  tRNA-Arg  98.28 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385714  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0040  tRNA-Arg  96.77 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0042  tRNA-Arg  96.77 
 
 		 75 bp  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0045  tRNA-Arg  98.25 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.350958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0050  tRNA-Arg  98.25 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0009  tRNA-Arg  98.25 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0023  tRNA-Arg  98.25 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0058  tRNA-Arg  98.25 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0069  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2639  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1010  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1126  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0253785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1133  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0017  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.034948 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0137  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0067  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0069  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0042  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0929  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0077  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1291  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0069  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0022  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0021  tRNA-Arg  93.1 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.223041  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0034  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00539974  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0050  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0048  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0481693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0045  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0054  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0043  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0058  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.794524  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2534  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2623  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.655713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2637  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576799  hitchhiker  0.0000000000000106236 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2748  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0366523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2583  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0049  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0006  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0009  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162102  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04383  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60480  tRNA-Arg  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3581  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000214954 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0024  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.278422  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0030  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0037  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.111991  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0551  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg04  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00038  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4678  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5046  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0042  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.113086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2508  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2782  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0054  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0046  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.426142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0035  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0035  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0067  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00807797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0031  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t62  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>