46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0551 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0551  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0045  tRNA-Arg  89.55 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0048  tRNA-Arg  89.55 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0481693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0041  tRNA-Arg  88.06 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540333  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4227  tRNA-Arg  88.06 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0074  tRNA-Arg  88.06 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.280915  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0397  tRNA-Arg  88.06 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0993004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0019  tRNA-Arg  88.06 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0109  tRNA-Arg  88.89 
 
 
72 bp  60  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0292794  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0069  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0069  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0017  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.034948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0063  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0009  tRNA-Arg  89.8 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0137  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476936  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1133  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1126  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1010  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1291  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2639  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0077  tRNA-Arg  88.68 
 
 
72 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0929  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164409  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0067  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0069  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0042  tRNA-Arg  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0023  tRNA-Arg  89.8 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0040  tRNA-Arg  91.89 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0050  tRNA-Arg  91.89 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0042  tRNA-Arg  91.89 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284385  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0045  tRNA-Arg  91.89 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.350958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0009  tRNA-Arg  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0042  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0054  tRNA-Arg  85.94 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0058  tRNA-Arg  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0012  tRNA-Arg  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783409  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0008  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00037457  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2583  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464864  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2637  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576799  hitchhiker  0.0000000000000106236 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2623  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.655713  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2534  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2748  tRNA-Arg  87.23 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0366523  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0058  tRNA-Arg  87.23 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.794524  normal  0.203632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>