20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0109 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0109  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0292794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0045  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0048  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0481693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0019  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0041  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0397  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0993004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0074  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.280915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4227  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0054  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0551  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0058  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.794524  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2583  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2637  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576799  hitchhiker  0.0000000000000106236 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2623  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.655713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2534  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2748  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0366523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1143  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000739144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000017876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0033  tRNA-Arg  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0146556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0012  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>