30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Arg-5 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000017876  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1143  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000739144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4678  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2637  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576799  hitchhiker  0.0000000000000106236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2583  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2782  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2508  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0042  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.113086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2623  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.655713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2534  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2748  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0366523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3581  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000214954 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5046  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0058  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.794524  normal  0.203632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00038  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0037  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.111991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60480  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0033  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0146556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0054  tRNA-Arg  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t62  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0041  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0054  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0019  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0397  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0993004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0109  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0292794  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0074  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.280915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4227  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0019  tRNA-Arg  83.1 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.240544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0035  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0035  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>