67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_R0048 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0481693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0058  tRNA-Arg  96.83 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.794524  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0041  tRNA-Arg  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540333  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2748  tRNA-Arg  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0366523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2534  tRNA-Arg  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2623  tRNA-Arg  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.655713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2637  tRNA-Arg  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576799  hitchhiker  0.0000000000000106236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2583  tRNA-Arg  96.83 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0019  tRNA-Arg  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0397  tRNA-Arg  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0993004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0074  tRNA-Arg  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.280915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4227  tRNA-Arg  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0054  tRNA-Arg  98.21 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0037  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.111991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2508  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0042  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.113086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5046  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4678  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2782  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00038  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3581  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000214954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0067  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0069  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0929  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0017  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.034948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0069  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0063  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0042  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0069  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476936  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0137  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1133  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1126  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1010  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0077  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1291  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2639  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993285  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0040  tRNA-Arg  92.06 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0045  tRNA-Arg  92.06 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.350958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0050  tRNA-Arg  92.06 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0042  tRNA-Arg  92.06 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0067  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00807797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0109  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0292794  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0049  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0022  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0551  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0009  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0058  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0023  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0009  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60480  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0012  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0050  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385714  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0054  tRNA-Arg  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0034  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00539974  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0008  tRNA-Arg  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t62  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198832 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0021  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.223041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0033  tRNA-Arg  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0146556 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0029  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00037457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0050  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190764 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1143  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000739144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>