41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tArg04 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_tArg04  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0030  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143147 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476936  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0049  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0069  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0069  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0017  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.034948 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0137  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1133  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1126  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1010  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2639  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0067  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1291  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0077  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0069  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14016  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0929  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0042  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0058  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0010  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.523644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0050  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0022  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt32  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0045  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.350958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0042  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0018  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0963196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0040  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0050  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385714  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0009  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0023  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0021  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.223041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0063  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0001  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0009  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0034  tRNA-Arg  84.38 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00539974  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0012  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0058  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R13  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0019  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.552856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0054  tRNA-Arg  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0030  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>