27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0058 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0010  tRNA-Arg  93.44 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.523644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0001  tRNA-Arg  90.32 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg04  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1010  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0030  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143147 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0069  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0069  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0017  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.034948 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0137  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1133  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1126  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0253785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2639  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0067  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0069  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0042  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0929  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0077  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1291  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0030  tRNA-Arg  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0045  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.350958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0054  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0042  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0050  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0040  tRNA-Arg  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>