8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_R0030 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0018  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0963196 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0030  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 72 bp  83.8  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0010  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.523644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0058  tRNA-Arg  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt32  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg04  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>