19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_R0001 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0010  tRNA-Arg  96.72 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.523644 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0030  tRNA-Arg  92.19 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0058  tRNA-Arg  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0018  tRNA-Arg  97.62 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0963196 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt32  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg04  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0002  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0050  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.989486  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0047  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0035  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0050  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0047  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0035  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000429398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0002  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  87.04 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>