11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5225 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5225  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4264  hypothetical protein  31.86 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4743  hypothetical protein  30.23 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.307237 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5469  hypothetical protein  28.84 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0415532 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0068  putative type IV conjugative transfer system coupling factor  22.87 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6798  hypothetical protein  25.93 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635417  normal  0.58588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0880  hypothetical protein  29.5 
 
 		 249 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1453  hypothetical protein  29.5 
 
 		 249 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.186215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2599  hypothetical protein  30.85 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4263  hypothetical protein  28.21 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000478781  normal  0.218564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3013  hypothetical protein  33.04 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>