12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6798 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6798  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635417  normal  0.58588 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5616  hypothetical protein  66.67 
 
 		 201 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6312  hypothetical protein  40.1 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1515  hypothetical protein  36.63 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5180  hypothetical protein  36.63 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3749  hypothetical protein  31.46 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4743  hypothetical protein  26.34 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.307237 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4332  hypothetical protein  25.6 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.984204 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4264  hypothetical protein  25.26 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5225  hypothetical protein  25.93 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5469  hypothetical protein  25.26 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0415532 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0068  putative type IV conjugative transfer system coupling factor  20.95 
 
 		 209 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>