11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5180 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1515  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5180  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6312  hypothetical protein  49.76 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5616  hypothetical protein  36.14 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6798  hypothetical protein  36.63 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635417  normal  0.58588 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4332  hypothetical protein  25.84 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.984204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3749  hypothetical protein  25.24 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4743  hypothetical protein  19.79 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.307237 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4264  hypothetical protein  27.27 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0068  putative type IV conjugative transfer system coupling factor  25.16 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2816  hypothetical protein  25.33 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.572858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>