More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4419 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4497  acetyl-CoA acetyltransferase  81.84 
 
 
394 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509306  normal  0.249354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4419  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
395 aa  788    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0739  thiolase  93.92 
 
 
395 aa  745    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100199  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3058  acetyl-CoA acetyltransferase  74.42 
 
 
394 aa  614  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1953  acetyl-CoA acetyltransferase  73.21 
 
 
395 aa  607  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0102019  normal  0.550682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7471  acetyl-CoA acetyltransferase  76.15 
 
 
392 aa  584  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.818426  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4738  thiolase  69.72 
 
 
394 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2706  acetyl-CoA acetyltransferases  69.72 
 
 
394 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21761  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  68.8 
 
 
394 aa  547  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  50.78 
 
 
394 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 
402 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
392 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
394 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
392 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
392 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 
395 aa  368  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
396 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  48.7 
 
 
393 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 
393 aa  365  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
392 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
392 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  48.7 
 
 
393 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
393 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
393 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
392 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
392 aa  363  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  47.47 
 
 
394 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  48.98 
 
 
394 aa  359  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.26 
 
 
391 aa  359  4e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 
393 aa  359  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  50 
 
 
394 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  50 
 
 
394 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  50 
 
 
394 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  47.22 
 
 
394 aa  358  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  50 
 
 
427 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  49.49 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  49.75 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  49.75 
 
 
427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  49.75 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  49.11 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  48.85 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  49.62 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
391 aa  355  7.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.59 
 
 
396 aa  355  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.59 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 
395 aa  353  4e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 
394 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  49.36 
 
 
394 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  44.04 
 
 
392 aa  352  7e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  49.36 
 
 
394 aa  352  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2373  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
394 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02151  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
394 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
394 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.39386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02110  hypothetical protein  48.72 
 
 
394 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
395 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
394 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
393 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
394 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
395 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
392 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
393 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
393 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
393 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
393 aa  349  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  48.22 
 
 
394 aa  349  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 
393 aa  349  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  348  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  48.99 
 
 
396 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 
396 aa  348  9e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 
393 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 
393 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  44.86 
 
 
399 aa  346  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  47.72 
 
 
394 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  45.88 
 
 
391 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 
392 aa  345  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  47.44 
 
 
392 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
401 aa  345  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>