22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7123 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  100 
 
 		 351 aa  722    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  48.99 
 
 		 349 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  0.000000000311645 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  38.43 
 
 		 269 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  38.43 
 
 		 269 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  38.43 
 
 		 269 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  39.3 
 
 		 276 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  40.73 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  34.9 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  34.11 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  27.36 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  29.2 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  30 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  29.95 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4008  RecT protein  30.88 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0939  RecT family protein  27.41 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3047  RecT protein  34.73 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00571481  normal  0.0332137 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  35.67 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  28.49 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1674  recombinational DNA repair protein (RecE pathway)  27.27 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1419  phage recombinase  27.35 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000444725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  33.14 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  29.38 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>