20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1674 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1674  recombinational DNA repair protein (RecE pathway)  100 
 
 		 310 aa  640    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1419  phage recombinase  34.91 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000444725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0939  RecT family protein  29.54 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  29.55 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  0.000000000311645 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  30.45 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  26.91 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  25.37 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  25.37 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  25.37 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  27.6 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  24.61 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  24.38 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  28.86 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  28.36 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  28.49 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  24.54 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  22.65 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  22.61 
 
 		 307 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  24.23 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  21.1 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>